1999年，农业部启动“沃土工程”，用微生物科学与现代农业技术相结合，通过补充土壤有机质、有益菌群、合理补充营养元素，让被破坏的土壤重新焕发生机，变得疏松、通透、肥沃、健康起来，大幅度减少病虫害的发生，加上生物、环保的植保预防措施让化肥、农药（尤其是化学农药）的使用量减少下来，即保证了农产品的高产、优质，又减少了人力、物力的投入，呵护了生态环境。

    “沃土工程”项目内容是“增、提、改、防”四个字。“增”就是增加有机肥投入，“提”就是提高肥料利用效率，“改”就是改造中低产田，“防”就是防止土壤污染。

    广西土壤肥料工作站根据自治区农业厅实施科学发展“钱粮双增”的意见和三个千万亩增粮增收行动计划，及时制定了相关方案，不断增大实施“沃土工程”力度，以增施有机肥为重点，实行“增、提、改、防”技术措施相结合，大力推广秸秆还田，积制优质农家肥，恢复和发展绿肥，全面提升土壤有机质，培育高产稳产农田，支撑粮食高产创建和粮食安全生产。

    2004 年，农业部启动第一轮沃土工程项目，首先在12个省(自治区、市)实施，广西是其中之一。早在全国正式启动该项目前，广西已于2003年12月出台文件明确该项目由自治区农业厅承担，自治区土肥站负责具体实施。项目投资750万元，要求在两个县建立示范区，通过改善农田基本条件，改良土壤不良因素，增施有机肥，实行秸秆还田等措施，使土壤肥力提高一个等级，粮食产量提高6%以上。

    随后，广西在武鸣、灵川两县建立示范区，实施面积73.3千公顷，修建了一批田间排灌工程，对农田低产因素进行了有针对性的改良和培肥,并建立了1个测土配方施肥配肥厂，完善了项目区土肥农化服务体系。项目区耕地生产能力得到大幅度提高，水稻增产10.2%至13. 7%，玉米增产11.4%,甘蔗增产11.4%，木薯增产12. 1%;土壤养分状况明显提高，项目实施后与实施前比较,土壤有机质增加0.2个至0.5个百分点，速效磷增加1.25毫克/千克至4.85毫克/千克，速效钾增加6.25毫克/千克至21.5毫克/千克。

    广西结合“沃土工程”项目的实施，创造性地组织实施“土壤诊断施肥网络工程”，实行“测、配、产、供、施”一条龙技术服务活动，此举得到农业部的充分肯定和好评，称赞“广西开展‘测—配—产—供—施’一条龙技术服务，实施‘沃土工程’有新举措”，这则重要消息登载在农业部《种植业司快报》上，很快传遍全国，一些省份慕名前来参观。经过十年的探索实践，为后来大规模推广测土配方施肥打下了坚实的基础。

广西灵川县测土配方施肥小区试验田